Site Naturel
Cascade de la Billaude
LE VAUDIOUX 

Site Naturel
Lac de Pannecière
CHAUMARD 
Site Naturel
Le Saut de l'Ognon
SERVANCE-MIELLIN 
Site Naturel
Réservoir du Tillot
ROUVRES-SOUS-MEILLY 
Site Naturel
4 lacs
LE FRASNOIS 
Site Naturel
Route touristique "montagnes du jura"
PONTARLIER 
Site Naturel
Cascades du Flumen (classé patrimoine naturel d'intérêt national)
SAINT-CLAUDE 
Site Naturel
Grand site naturel des Cascades du Hérisson

Site Naturel
Lac de Vesoul-Vaivre
VAIVRE-ET-MONTOILLE 
Site Naturel
Lac de Vouglans
LA TOUR-DU-MEIX 
Site Naturel
Lac de Ravilloles
RAVILLOLES 
Site Naturel
La cascade de Syratu
MOUTHIER-HAUTE-PIERRE 
Site Naturel
Sentier botanique du Moulin de Vanneau
SAINTS-EN-PUISAYE 
Site Naturel
Lacs d'Étival
ETIVAL 
Site Naturel
Lac Saint Point Lamartine
SAINT-POINT 
Site Naturel
Lac de Besain
BESAIN 
Site Naturel
Lac de Marcilly-sur-Tille
MARCILLY-SUR-TILLE 
Site Naturel
Lac d'Antre
VILLARDS-D'HERIA 
Site Naturel
Réserve naturelle de la Tourbière de la Grande Pile
SAINT-GERMAIN 
Site Naturel
Cascade et reculée de la Frasnée
LA FRASNEE 
Site Naturel
Le lac des Rousses
LES ROUSSES 
Site Naturel
Réservoir de Panthier
VANDENESSE-EN-AUXOIS 
Site Naturel
Lac des rouges truites
LAC-DES-ROUGES-TRUITES 
Site Naturel
Le lac d'Ilay
LA CHAUX-DU-DOMBIEF