Site Naturel
Lac de Saint-Point
MALBUISSON 

Site Naturel
Source du Bief de la Ruine et Creux des Joyaux
FONCINE-LE-HAUT 
Site Naturel
Lac de Narlay
LE FRASNOIS 
Site Naturel
Cascade et reculée de la Frasnée
LA FRASNEE 
Site Naturel
Les Gorges de l'Abîme
SAINT-CLAUDE 
Site Naturel
Lac d'Antre
VILLARDS-D'HERIA 
Site Naturel
Reculée des Planches et cascade des Tufs
LES PLANCHES-PRES-ARBOIS 
Site Naturel
Lac de Saint-Agnan
SAINT-AGNAN 
Site Naturel
Cascade du Cirque du Bout du Monde
CORMOT-VAUCHIGNON 
Site Naturel
Réserve naturelle du lac de Remoray
LABERGEMENT-SAINTE-MARIE 
Site Naturel
Cascade du Gour de Conche et Roche Tuffiere
MYON 
Site Naturel
Lac de Marcilly-sur-Tille
MARCILLY-SUR-TILLE 
Site Naturel
Lac de Chanon
MARTIGNA 
Site Naturel
Cascade de Pissevieille
LA RIXOUSE 
Site Naturel
Réservoir du Tillot
ROUVRES-SOUS-MEILLY 
Site Naturel
Sentier botanique du Moulin de Vanneau
SAINTS-EN-PUISAYE 
Site Naturel
Les bassins et le Saut du Doubs
VILLERS-LE-LAC 
Site Naturel
Lac de Fort du Plasne
FORT-DU-PLASNE 
Site Naturel
Les Etangs de Vaux et Baye
BAZOLLES 
Site Naturel
Grand site naturel des Cascades du Hérisson

Site Naturel
4 lacs
LE FRASNOIS 
Site Naturel
Gorges de Malvaux - Bief de la Ruine
FONCINE-LE-BAS 
Site Naturel
Lac de Clairvaux
CLAIRVAUX-LES-LACS 
Site Naturel
Le Saut de l'Ognon
SERVANCE-MIELLIN