Site Naturel
Gorges de Malvaux - Bief de la Ruine
FONCINE-LE-BAS 

Site Naturel
Lac de Chanon
MARTIGNA 
Site Naturel
Lac de Chaumeçon
SAINT-MARTIN-DU-PUY 
Site Naturel
Cascade de Saint Hymetière
SAINT-HYMETIERE-SUR-VALOUSE 
Site Naturel
Lacs d'Étival
ETIVAL 
Site Naturel
Sentiers de Chaumour
SAINT-REMY 
Site Naturel
Le grand saut
RENEDALE 
Site Naturel
La Résurgence de la Grotte des Planches
LES PLANCHES-PRES-ARBOIS 
Site Naturel
Lac de Cuttura
COTEAUX DU LIZON 
Site Naturel
Lac de Vesoul-Vaivre
VAIVRE-ET-MONTOILLE 
Site Naturel
Lac de Saint-Agnan
SAINT-AGNAN 
Site Naturel
Reculée des Planches et cascade des Tufs
LES PLANCHES-PRES-ARBOIS 
Site Naturel
Cascade du Cirque du Bout du Monde
CORMOT-VAUCHIGNON 
Site Naturel
Cascade de la Quinquenouille
VALZIN EN PETITE MONTAGNE 
Site Naturel
Source du Lison
NANS-SOUS-SAINTE-ANNE 
Site Naturel
Belvédère de la Roche Bernard
BELLEFONTAINE 
Site Naturel
Lac d'Antre
VILLARDS-D'HERIA 
Site Naturel
Lac de Narlay
LE FRASNOIS 
Site Naturel
La source du Pontet
MOUTHIER-HAUTE-PIERRE 
Site Naturel
Cascade du Moulin de Vermondans
PLAIMBOIS-VENNES 
Site Naturel
Les bassins et le Saut du Doubs
VILLERS-LE-LAC 
Site Naturel
Grottes de Baume-les-Messieurs
BAUME-LES-MESSIEURS 
Site Naturel
Le lac des Rousses
LES ROUSSES 
Site Naturel
Cascades du Flumen (classé patrimoine naturel d'intérêt national)
SAINT-CLAUDE