Site Naturel
Lac des Settons
MONTSAUCHE-LES-SETTONS 

Site Naturel
Lac Saint Point Lamartine
SAINT-POINT 
Site Naturel
Cascade et reculée de la Frasnée
LA FRASNEE 
Site Naturel
Réservoir de Cercey
THOISY-LE-DESERT 
Site Naturel
Le belvédère des 4 Lacs
LA CHAUX-DU-DOMBIEF 
Site Naturel
Le Réservoir du Crescent
MARIGNY-L'EGLISE 
Site Naturel
Le Saut de l'Ognon
SERVANCE-MIELLIN 
Site Naturel
Lac de Saint-Point
MALBUISSON 
Site Naturel
Source de l'Ain et ses cascades
CONTE 
Site Naturel
Lac de Chamboux
SAINT-MARTIN-DE-LA-MER 
Site Naturel
La Résurgence de la Grotte des Planches
LES PLANCHES-PRES-ARBOIS 
Site Naturel
Lac d'Antre
VILLARDS-D'HERIA 
Site Naturel
Lac de Clairvaux
CLAIRVAUX-LES-LACS 
Site Naturel
Réserve naturelle de la Tourbière de la Grande Pile
SAINT-GERMAIN 
Site Naturel
Cascades du Flumen (classé patrimoine naturel d'intérêt national)
SAINT-CLAUDE 
Site Naturel
Le lac d'Ilay
LA CHAUX-DU-DOMBIEF 
Site Naturel
Cascade du Saut Girard - Cascades du Hérisson
LA CHAUX-DU-DOMBIEF 
Site Naturel
Source du Bief de la Ruine et Creux des Joyaux
FONCINE-LE-HAUT 
Site Naturel
Reculée des Planches et cascade des Tufs
LES PLANCHES-PRES-ARBOIS 
Site Naturel
Les bassins et le Saut du Doubs
VILLERS-LE-LAC 
Site Naturel
La source du Pontet
MOUTHIER-HAUTE-PIERRE 
Site Naturel
Lac de Marcilly-sur-Tille
MARCILLY-SUR-TILLE 
Site Naturel
L'Échappée des 1000 étangs
MELISEY 
Site Naturel
Le lac des Rousses
LES ROUSSES