Site Naturel
Les bassins et le Saut du Doubs
VILLERS-LE-LAC 
Site Naturel
Cascades du Flumen (classé patrimoine naturel d'intérêt national)
SAINT-CLAUDE 
Site Naturel
Grand site naturel des Cascades du Hérisson
Site Naturel
Lac de Ravilloles
RAVILLOLES 
Site Naturel
Lac de Vouglans
LA TOUR-DU-MEIX 
Site Naturel
Lac de Bonlieu
BONLIEU 
Site Naturel
La cascade du Bief de la Chaille et le pont Perroud
LES ROUSSES 
Site Naturel
Domaine départemental des Grands-près
SAINT-AGNAN 
Site Naturel
Reculée des Planches et cascade des Tufs
LES PLANCHES-PRES-ARBOIS 
Site Naturel
Les Gorges de l'Abîme
SAINT-CLAUDE 
Site Naturel
Parcours familial des cascades du Hérisson
LA CHAUX-DU-DOMBIEF 
Site Naturel
Réservoir de Cercey
THOISY-LE-DESERT 
Site Naturel
Cascade de Pissevieille
LA RIXOUSE 
Site Naturel
Parcours intégral des cascades du Hérisson
LA CHAUX-DU-DOMBIEF 
Site Naturel
Cascade de Baume-les-Messieurs
BAUME-LES-MESSIEURS 
Site Naturel
Lac de Cuttura
COTEAUX DU LIZON 
Site Naturel
Cascade de la Vouivre
SAINT-CLAUDE 
Site Naturel
Lac de Narlay
LE FRASNOIS 
Site Naturel
Lac de l'Abbaye et Belvédère du Moulin
GRANDE-RIVIERE CHATEAU 
Site Naturel
L'Échappée des 1000 étangs
MELISEY 
Site Naturel
Le Saut de Gouloux
GOULOUX 
Site Naturel
Lac de Chanon
MARTIGNA 
Site Naturel
Lac de l'Embouteilleux
LA PESSE 
Site Naturel
Gorges de Narvau
LORMES